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Este programa de investigación cuenta con las siguientes líneas de trabajo:
- Antiterrorismo y terrorismo yihadista. Fue el origen del Grupo de Estudios en Seguridad Internacional. Son numerosas las publicaciones de GESI que tratan sobre ambos temas. También se enmarcan en esta línea los siguientes proyectos: Observatorio sobre la actividad yihadista en el Magreb y el Sahel Occidental, que ofrece una recopilación de los principales ataques armados y hechos destacables sobre el yihadismo en ambas regiones; Observatorio sobre la actividad yihadista en España, que incluye tres apartados: recopilación de las menciones a España en la propaganda yihadista, listado de operaciones policiales contra el yihadismo (1995-2016) en territorio español y distribución geográfica de estas últimas (1995-2016); y Base de datos de incidentes yihadistas en Europa Occidental (2001-2013), trabajo vinculado al proyecto del Plan Nacional I+D+I CSO2010-17849 "La estructura organizativa del terrorismo internacional: Análisis de su evolución y de sus implicaciones para la seguridad europea", finalizado en diciembre de 2013.
- Teoría de los conflictos armados, insurgencia y contrainsurgencia. Es otra de línea tradicional de GESI, vinculada inicialmente a proyectos de investigación con el Mando de Adiestramiento y Doctrina del Ejército de Tierra (MADOC).
- Muy relacionada con la anterior: Misiones internacionales de mantenimiento de paz y de estabilización posconflicto.
- Y otras áreas de trabajo colindantes, como proliferación de armas de destrucción masiva y geopolítica de los recursos.
Los trabajos de GESI prestan especial atención al Magreb, Sahel y Oriente Próximo, pero no de manera exclusiva. También se analizan las dinámicas de seguridad relacionadas con Rusia, y Asia Pacífico-China. Y se pretende profundizar en el estudio de la Seguridad en Iberoamérica. Para ello GESI colabora académicamente con el Centro de Estudios Estratégicos de la Academia de Guerra del Ejército de Chile y con la Maestría de Relaciones Internacionales de la Universidad de El Salvador (Argentina).
